Высшим органом управления Северного Форума является Совет губернаторов, который в 90-х годах назывался также Совет директоров. С началом XXI века утвердилось название Совет губернаторов.

Совет возглавляется председателем. В зависимости от численности регионов – членов в определенные периоды, избираются заместители председателя. В начале истории было 5 заместителей по географическому признаку: Северная Америка, Северная Европа, Азия, Западная и Восточная Россия. В настоящее время, в Совете губернаторов избирается один заместитель председателя.

В 1994 г., в знак признания заслуг Губернатора Аляски Уолтера Хикеля, была введена почетная должность Генерального секретаря, в которой он прослужил до конца жизни.

Также некоторое время функционировал Консультативный совет Северного Форума, в который входили бывшие председатели Северного Форума.